福建生物工程职业技术学院顺应时代潮流应运而生，于2005年5月在原福建医药学校的基础上正式组建，是一所全日制公办高等职业院校。建校以来，已培养健康产业专门人才3万多名。
学校地处福州市区的闽江之畔，现有洪山桥和铜盘2个校区，总占地190多亩；新校区地块占地306亩，位于福州市晋安区五四北，毗邻福州国家森林公园、北峰和鼓岭风景区。
学院于2011年1月通过高等职业院校人才培养工作评估，现有教职工246人，其中博士、硕士占26.83%，高级职称占专业技术人员25.14%，“双师型”占专任教师61.54%。建有5个系（药学系、中药系、生物工程系、保健营养学系、管理系）、13个专业（生物技术及应用、化妆品技术与管理、生物制药技术、中药制药技术、药物制剂技术、药物分析技术、食品药品监督管理、药品经营与管理、保健品开发与管理、医疗器械制造与维护、食品营养与检测、药学、中药），其中保健品开发与管理、中药2个专业为国家重点建设专业，生物制药技术、中药、药品经营与管理3个专业为省级精品专业；与福建农林大学联办食品科学与工程、食品质量与安全等两个自考本科专业，与福建中医药大学联办中药学自考本科专业。现有各类在校生6000多人。
设有11个教学教辅部门和10个党政工作部门，实行院、系二级管理。开设药物制剂技术、药物分析技术、中药、生物制药技术、保健品开发与管理、食品药品监督管理、药品经营与管理等7个专业，其中生物制药技术、中药、药品经营与管理等3个专业被评为省级精品专业。生物制药教学科研实训中心列入2009年省级财政支持的高职院校示范性实训基地建设项目。
福建生物工程职业技术学院国标代码 ：13969
福建生物工程职业技术学院毕业证编号（电子注册号） 编号规则 : 98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。
福建生物工程职业技术学院毕业证编号 （电子注册号）示例 :13969 1 2008 06 006826
福建生物工程职业技术学院毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
本中心库存全国各地大中专院校的历年毕业证原版样本。存有历任校（院）长签名章样本。