吉林医药学院基础医学院成立于1993年11月，前身为空军医学高等专科学校基础部，编制16个教研室（中心），教职人员204人。1999年7月，转隶为第四军医大学吉林军医学院基础部，2004年8月吉林军医学院整体移交吉林省独立办学，基础部随之更名为吉林医药学院基础医学院。 现有外语、组织学与胚胎学、人体解剖学、生理学、生物化学与分子生物学、病理学与病理生理学、药理学7个教研室；基础医学实验中心1个，下设形态实验室、机能实验室、生物化学与分子生物学实验室，承担学校的大学英语和基础医学课程的教学和实验任务。基础医学院现有教职员工108人，其中教授16人，副教授28人；博士12人，硕士64人。
医学影像学专业主要课程
主干学科：基础医学、临床医学、医学影像学。
主要课程：人体解剖学、组织学与胚胎学、生理学、生物化学、病理学、药理学、病理生理学、诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、医学影像检查技术、医学影像设备学、放射诊断学、超声诊断学、放射治疗学、CT、MRI诊断学、介入放射学、核素诊断学。