1956年，内蒙古医学院成立，开始招收本科生，是中国在少数民族地区最早建立的高等医学院校之一，隶属于国家卫生部。
1958年，学校划归内蒙古自治区管理。
1978年，学校开始招收研究生。
1981年，学校获得硕士学位授权资格。
1982年，内蒙高教局批准该校正式成立校级学位评定委员会。
1986年，学校在教务处内设立研究生科，配备了专职人员，从此研究生教育开始了规范化教育阶段。
1998年，学校成立了研究生处级建制单位，教务处原研究生科的管理职能划归研究生处，同时撤消研究生科。
1999年，学校获得同等学力人员申请硕士学位的授权资格。
2001年，学校机构改革，研究生处改制为研究生部并划为业务职能部门。
2003年，学校获准成为临床医学硕士专业学位培养单位。
2004年，学校成立了研究生学院同时撤消了研究生部，属于二级教学单位。
2007年，学校顺利通过国家教育部本科教学工作水平评估，被评为“优秀”等次。
2009年，学校获准成为口腔医学硕士专业学位培养单位。被内蒙古自治区政府确定为自治区博士学位授权立项建设单位。
内蒙古医科大学
2012年3月，经教育部批准，内蒙古医学院正式更名为内蒙古医科大学。
内蒙古医学院国标代码 ：10132
内蒙古医学院毕业证编号（电子注册号） 编号规则 : 98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。
内蒙古医学院毕业证编号 （电子注册号）示例 :10132 1 2008 06 006826
内蒙古医学院毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
本中心库存全国各地大中专院校的历年毕业证原版样本。存有历任校（院）长签名章样本。