安徽医科大学临床医学院是2003年由安徽医科大学创建，是经国家教育部和安徽省人民政府批准设立的独立学院；是安徽省纳入第二批本科录取的全日制普通高等教育本科院校。
学院秉承安徽医科大学90余年的文化传统和办学理念，坚持“以教学为中心，以学生为主体”的办学宗旨，坚持“科学定位，特色办学、质量兴校”的发展思路。2017年11月遵照教育部26号令要求，由安徽医科大学与安徽新华集团投资有限公司合作举办，是按新机制和新模式运行的本科高校。2019年，独立学院转设纳入教育部十三五规划。
据2019年9月学院官网显示，学院先后建立了基础医学部、临床医学系、卫生管理学系、护理学系、药学系、公共课程部、思想政治理论课教学研究部和生物医学系。开设有临床医学、医学影像技术、医学检验技术、护理学、药学、生物医学工程、眼视光学、、康复治疗学、公共事业管理和健康服务与管理等本科专业。学生学完规定课程和实践、实习内容，经考核合格的、符合学位授予的发放由教育部注册的安徽医科大学临床医学院毕业证书、学士学位证书。
学院现拥有两个校区：南校区位于合肥市经开区翡翠路15号；相山路校区位于合肥市新站区相山路789号 。新建设新校区位于合肥市蜀山区小庙工业园。
师资力量
临床医学院依托安徽医科大学的师资力量和办学资源（以下参考安徽医科大学）。
截至2014年4月，该校共有在职教职工3733人，专任教师队伍中具有博士、硕士学位的教师占88.72%，博士生导师178人，硕士生导师1356人。
有国家“百千万人才工程”，教育部骨干教师，卫生部、人事部突出贡献中青年专家，全国首批青年拔尖人才，“百人计划”，“皖江学者”特聘教授，高校领军人才等30人次。
有16人次在国际学术组织和SCI源期刊任职，6人次担任国家“十一五”、“十二五”规划教材主编。3人担任国家级专科学会主委，1人在亚洲学术组织担任主席，9人入选教育部高校医药学科指导委员会专家。10多人获得全国、全省模范教师、优秀教师光荣称号。
有1个高校高端人才引进团队，1个教育部科技创新团队，2个安徽省科技创新团队，3个安徽省“115”科技产业创新团队。1名教授入选“万人计划”第一批教学名师。
教育部科技创新团队：皮肤病遗传学创新团队
安徽省科技创新团队：中药抗炎免疫药理学科技创新团队、皮肤病的遗传学研究团队
安徽省“115”产业创新团队：肝硬化食管静脉曲张出血防治技术应用与开发创新团队、抗炎免疫药物的基础与应用研究创新团队、造血干细胞移植创新团队
教学单位
该院设有基础医学院、护理学院、卫生管理学院、第一临床学院（第一附属医院）、第二临床学院（第二附属医院）、巢湖临床学院（附属巢湖医院）、第四临床学院（第四附属医院）、省立临床学院、阜阳临床学院等教学机构。
学术研究
研究机构
学校成立了临床药理、皮肤病、卫生事业管理等65个省、校级研究所。编辑出版的国家级及面向全国发行的期刊有《安徽医科大学学报》、《中国药理学通报》、《临床与实验病理学杂志》、《中华疾病控制杂志》等15种。学校藏书86万余册，中外文印刷期刊及网络电子版期刊30余万册，为全国生物医学文献资源共享网络安徽省级中心馆。
学校同德国、瑞典、美国、加拿大、日本、韩国以及台湾、香港地区的高等院校开展了密切的交流，双方互派专家学者、互派学生、相互交流信息资料、共同开展科研合作。
研究成果
学校共承担“863”、“973”计划、国家科技支撑计划和国家自然科学基金项目等192项。国家自然科学基金立项数，获国家科技进步二等奖一项、高校自然科学技术奖一等奖一项、中华医学科技奖一等奖三项、中华医学科技奖医学科普奖一项。
2009年度，该校发表论文全国高校排名第44位，全国医药类高校排名第12位，国内论文被引全国高校排名第66位。先后以责任作者单位在《新英格兰医学杂志》、《自然遗传学》等国际著名SCI刊物发表多篇研究论文。
该校张学军教授研究组利用全基因组关联研究发现银屑病、白癜风和麻风病易感基因的研究成果被评为2010年度中国科学十大进展之一。
安徽医科大学临床学院国标代码 ：13618
安徽医科大学临床学院毕业证编号（电子注册号） 编号规则 : 98年前编号编写没有规则 ，2000-2002年为17位，2003年以后为18位。
前5位 （学校代码）.6位为办学类型代码 普通高等教育为1； 博士为2；硕士为3；学士为4；成人高等教育为5；高等教育自学考试(如自学考试编号：6开头)和高等教育学历文凭考试为6；网络教育为7。7-10位：为颁证年份. 11-12位：为培养层次代码：博士研究生01；硕士研究生02；学士学位04；本科05；专科（含高职）06 ,13-17或18位：为学校对毕业证书的流水编号。
安徽医科大学临床学院毕业证编号 （电子注册号）示例 :13618 1 2008 06 006826
安徽医科大学临床学院毕业证分类、打印规则、相片要求、签名章：
统招毕业证书：97年以前全是手写的,97年以后，陆续打印。相片从98以后，全部是彩色。成人教育毕业证书：2001以前，全部手写，相片黑白，2001年后，全部打印，相片彩色 。 自考毕业证书:2003以前自考,发证机关,都是省教委发放的样本。2000年左右毕业证的相片大多是红色的背景， 06,07年以后才要求是蓝色背景。校长签名章的种类从外形上区分有二大类,即方章,条章,八十年代九十年代基本上都是方章,二千年左右开始出现条章,现在校长签名章是方章条章并存!校长签名章在使用时候又分红蓝两种颜色,八十年代九十年代基本上都是红色,二千年左右开始出现蓝色,现在蓝色使用多过红色了!
本中心库存全国各地大中专院校的历年毕业证原版样本。存有历任校（院）长签名章样本。